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          北京畜牧兽医研究所猪基因组近交系数评估取得新进展

          2020-05-13 09:50:49来源:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所作者:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
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            近日,牧医所猪遗传育种创新团队在猪基因组近交系数评估上取得新进展千赢手机app下载官网{安全登录},为猪的育种保种工作和避免实际育种中的近亲交配提供了参考依据千赢手机app下载官网{安全登录}。
            据介绍千赢手机app下载官网{安全登录},连续纯合片段(runs of homozygosity, ROH)是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的千赢手机app下载官网{安全登录}千赢手机app下载官网{安全登录},基于ROH计算的基因组近交系数是个体真实的近交系数,它比传统系谱计算的期望近交系数更加准确,而且不再依赖于系谱记录的准确性和完整性,能准确地反映两个配子间的关系。
            研究针对2569个大白猪共检查到176182个ROH,其中ROH数目最多的染色体为6号,最少的为12号,而覆盖率最高为14号千赢手机app下载官网{安全登录},最低的为13号千赢手机app下载官网{安全登录}。研究进一步发现,检测到的ROH并非均匀分布在基因组上,通过ROH计算的平均基因组近交系数为0.14,而系谱为0.011千赢手机app下载官网{安全登录},两者的相关系数为0.35,并在ROH富集的基因组区段注释到与大白猪繁殖性状、肌肉发育和脂肪沉积相关的基因千赢手机app下载官网{安全登录},如: SIRT1 、 MYPN 千赢手机app下载官网{安全登录}、 SETDB1 和 PSMD4 ,为鉴定候选基因提供了有效的方法。
            研究成果已发表在农林科学1区和奶制品与动物科学1区的《Journal of Animal Science 和 Biotechnology》上千赢手机app下载官网{安全登录}。本文的第一作者为史良玉博士研究生和王立刚副研究员,通讯作者为王立贤研究员和赵福平副研究员。该研究得到国家自然科学基金项目(No.31572357)和生猪现代产业技术体系(CARS-35)支持千赢手机app下载官网{安全登录}。
            原文链接:https://jasbsci.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40104-020-00447-0 

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